Los valles interandinos de Santa Cruz, uno de los ecosistemas más representativos de Bolivia, carecen en la actualidad de protección ecológica, a pesar de constituir zonas donde la especialización biológica ha sido particularmente activa, conformando numerosos endemismos, confinados a áreas generalmente muy restringidas, opina el consultor Antonio Navarro Sánchez en uno de los estudios más completos y exhaustivos sobre los parques nacionales y otras áreas protegidas del Departamento, realizado por encargo del Proyecto de Protección de los Recursos Naturales de Santa Cruz y la Cooperación Financiera del Gobierno Alemán.
El área propuesta para protección como Parque Nacional de los Valles Cruceños comprende las porciones más occidentales de las provincias de Florida, Caballero y Vallegrande, así como pequeñas zonas limítrofes de la provincia Cordillera. En conjunto se articula en torno a un nudo hidrográfico de las juntas o región de confluencia y desembocadura en el rio Grande, de los rios Mizque, Ñancahuazú y Masicurí.