Viernes 29 de marzo 2024 Contacto

Llevamos semanas probando millones de fármacos contra el coronavirus




30/03/2020 - 15:32:05
SINC.- El bioinform�tico Alfonso Valencia, director del Instituto Nacional de Bioinform�tica (INB) y expresidente de la Sociedad Internacional de Biolog�a Computacional, fue de los primeros en Espa�a en aplicar el poder de los ordenadores al estudio de la vida. Tras liderar durante m�s de una d�cada el programa de Biolog�a Estructural y Biocomputaci�n en el Centro Nacional de Investigaciones Oncol�gicas (CNIO), en 2016 se traslad� al Barcelona Supercomputing Centre (BSC), donde dirige el departamento de Ciencias de la Vida.

Su grupo participa en uno de los proyectos que la Comisi�n Europea ha financiado con urgencia para investigaci�n sobre el coronavirus, y esperan arrancar pronto otros dos proyectos m�s. �Llevamos semanas ensayando en el superordenador MareNostrum la eficacia potencial de compuestos contra el SARS-CoV-2�, afirma. �Ensayaremos millones de compuestos, incorporando a los modelos los resultados experimentales que se van produciendo constantemente�.

Valencia explica tambi�n la importancia de identificar el origen animal de la epidemia, a�n desconocido, y recuerda que �es imprescindible� que los datos cient�ficos est�n disponibles.

Cuando comenz� la cuarentena escribi� en Twitter que tendr�a m�s tiempo para leer y la jardiner�a. �C�mo lo lleva?

Si algo estamos aprendiendo es que no se pueden hacer planes. Tanto yo como todos mis colegas estamos ahora m�s ocupados que nunca, trabajando en los nuevos proyectos sobre coronavirus e intentando continuar con el trabajo del grupo de investigaci�n, redes e infraestructuras, a la vez que intentamos contribuir a iniciativas sociales sobre la epidemia. As� que, de momento, ni jardiner�a ni lecturas. Eso s�, con una cierta disciplina en hacer ejercicio y mantener el contacto con familia y amigos.

La Comisi�n Europea les ha concedido un proyecto en una convocatoria de urgencia para investigar en f�rmacos y vacunas contra el coronavirus. �En qu� consiste?

Tenemos varias l�neas abiertas para generar modelos utilizando la informaci�n gen�mica y las estructuras de prote�nas del SARS-CoV-2. Estos modelos ayudar�n a dise�ar tanto f�rmacos como anticuerpos espec�ficos y potencialmente, vacunas. En el proyecto que ha concedido ahora la Comisi�n estamos probando computacionalmente la eficacia contra el coronavirus de muchos compuestos ya conocidos para que nuestros colegas los ensayen en varios sistemas experimentales.

�C�mo se prueba computacionalmente un compuesto?

Hay grandes librer�as de compuestos que se est�n utilizando como f�rmacos en otras enfermedades. Los modelos computacionales que aplican grupos como el de V�ctor Guallar (BSC) permiten probar en el ordenador si estas mol�culas encajan qu�micamente con las prote�nas del virus para poder inactivarlas. La prote�na que usa el virus para entrar a la c�lula ser�a una posible diana de estas mol�culas, pero tambi�n otras con actividades bioqu�micas conocidas. Los que se unen pasan a las siguientes etapas de ensayo, en c�lulas y animales. Es el proceso habitual del dise�o racional de f�rmacos que ahora estamos acelerando al m�ximo gracias a las capacidades de supercomputaci�n de MareNostrum.

�De cu�ntos compuestos estamos hablando?

Hay muchos, en MareNostrum llevamos semanas ensayando millones de compuestos. Lo ideal ser�a que encontr�semos actividad en un f�rmaco que ya est� aprobado para uso humano, as� adelantar�amos mucho.

�Podr�a haber resultados pronto?

Hay partes del proceso que se pueden acelerar, pero otras tienen inevitablemente sus tiempos. Nuestros modelos computacionales son parte de un proceso que incluye la validaci�n experimental. Y aspectos como el crecimiento de un cultivo celular o la respuesta de un animal a un ensayo tienen un tiempo biol�gico que no se puede cambiar. Adem�s, los resultados deben ser s�lidos y requieren demostraci�n y validaci�n. Trabajamos lo m�s r�pido que podemos, pero para ciertos pasos no hay atajos.

�Podr�a esta pandemia remitir antes de que encontr�ramos una cura?

Ser� fant�stico encontrar una cura para este episodio, pero lo m�s probable es que lo que aprendamos ahora nos prepare para el siguiente en cuanto a infraestructuras, f�rmacos, anticuerpos, vacunas.

Ha hablado de otras l�neas abiertas. �Cu�les son?

La Iniciativa de Medicamentos Innovadores (IMI), tambi�n de la Comisi�n Europea, representa la mayor colaboraci�n entre gobiernos y la industria farmac�utica. Como ya hicieron con el �bola en 2014, han lanzado ahora una convocatoria de unos 40 millones de euros en la que la industria pone a disposici�n de la comunidad cient�fica sus librer�as de compuestos, que son la base de su negocio. Estamos valorando presentarnos.

Sobre la validaci�n en animales, �est� claro qu� modelo animal ser� el m�s adecuado en el caso del nuevo coronavirus?

Eso lo abordamos en otro proyecto que pinta muy bien. Nosotros y el grupo de V�ctor Guallar, en el BSC, colaboramos con Juli� Blanco, Jorge Carrillo y Bonaventura Clotet, del Instituto IrsiCaixa, que desarrollan anticuerpos y vacunas, y con Quim Segal�s, en el Centre de Recerca en Sanitat Animal (CreSA), expertos en modelos animales en virolog�a, en especial coronavirus. A m� la parte de los animales me parece fascinante, hay coronavirus para todos los gustos, adaptados a un mont�n de especies. A�n no sabemos qu� modelo animal ser� el mejor para ensayar f�rmacos contra este, podr�a ir del rat�n al cerdo pasando por otras muchas posibilidades.

Para hacer los modelos computacionales ustedes necesitan analizar las secuencias gen�ticas del nuevo coronavirus. �Por qu�?

S�, la parte del an�lisis de secuencias y genomas es la m�s propia de mi grupo. Es fascinante y quiz�s m�s desconocida que la del dise�o de f�rmacos.

�Puede explicar en qu� consiste?

En biolog�a todo lo hacemos por comparaci�n. En este caso comparamos todas las secuencias de coronavirus disponibles, no solo de muestras humanas. De las animales aprendemos qu� hace posible el salto de unas especies a otras; y comparando secuencias de humanos vemos c�mo va cambiando el virus a medida que se propaga la infecci�n. La combinaci�n de estas informaciones nos da pistas para, por ejemplo, identificar regiones �tiles para dise�ar anticuerpos espec�ficos.

�Por qu� es tan importante saber c�mo se ha adaptado el nuevo virus a los humanos?

Entender qu� hace que este virus pueda proliferar en hu�spedes humanos es importante por al menos cuatro razones: comprender el origen de la epidemia; predecir y prevenir brotes futuros; seleccionar los mejores modelos animales; y analizar las secuencias y las estructuras de prote�nas para el dise�o racional de los medicamentos.

�Qu� se sabe sobre el origen animal de la epidemia?

Las secuencias son m�s similares a las de coronavirus de un grupo de murci�lagos. Eso concuerda con lo publicado hasta ahora. Pero podr�a haber otros organismos intermedios, antes del salto a humanos.

�Est� la comunidad cient�fica compartiendo todos los datos disponibles?

Se ha hecho un esfuerzo muy grande por poner r�pidamente accesibles las publicaciones, los modelos, las estructuras de prote�nas, etc�tera. Esto es muy positivo y �til. Las revistas han creado sistemas de revisi�n r�pida que tambi�n est�n bien. Siempre hay una parte negativa, y es que se han puesto en la web trabajos incorrectos, pero la comunidad los ha corregido muy r�pidamente.

�Qu� le parece la petici�n de crear un banco de datos abierto para luchar contra esta pandemia?

Es imprescindible que toda la informaci�n gen�mica y m�dica est� disponible. Hay otras iniciativas parecidas en marcha. El EMBL-EBI est� proponiendo la colaboraci�n de centros para crear ese tipo de repositorios de informaci�n. En cierto sentido esto refleja las limitaciones actuales que debemos superar en beneficio de todos. La informaci�n de inter�s biom�dico debe ser accesible no solo en las emergencias.

Estimados lectores: recuerden que estas noticias las pueden encontrar en nuestro Canal de Whastapp al momento de su publicación.

Sigue el canal de Hoybolivia.com en WhatsApp:
whatsapp.com/channel/0029Va8B7PQ3GJOyC41B2Q1a

Noticias Recientes de Virales

Copyright © Hoybolivia.com Reservados. 2000- 2024